口腔常在微生物叢解析センター マイクロバイオーム細菌叢解析

 

一般の方からのサンプル受付
MetaDentProject

谷口歯科医院

 

 

micro@tani8020.jp
香川県高松市常磐町2-3-35 087-831-8020 

 

今、腸内細菌叢(腸内フローラ)が大きく注目されています。
それと同じくらい複雑な細菌叢が我々歯科医師が対象とする口腔内にも形成されています。

谷口歯科医院では世界の歯科医院に先駆けて次世代シークエンサーMiSeqを導入し、 口腔細菌叢のメタゲノム解析に取り組んでいます。 また、培養や遺伝子解析による様々な微生物の検出も行っています。

第3世代シーケンサーであるNanopore社のGridIONを導入し、さまざまな研究機関との共同研究を経て新しい技術の開発・提供に努めていきます。Nanopore社の認証をゲノム解析大手のGeneBay,Takara Bioについで国内3番目に取得しました。6月4日よりNanopore GridIONを用いたシーケンスサービスも開始しています。

 

次回、あいのり可能なMiseq解析の予定

●V3-V4領域

 10月中旬 あいのり可 (10月12日頃サンプル到着締め切り)  
 10月下旬 あいのり可 (10月25日頃サンプル到着締め切り)  
その他、随時あいのりのでシーケンスを実施しています。
随時お問い合わせいただけましたら、最短でのあいのりでの解析の予定をお知らせします。
また単独での解析はいつでもお受けいたします。 

●V4領域

 10月06日 (10月04日サンプル到着締め切り)  
 10月20日 (10月18日サンプル到着締め切り)

現在、V4領域は2週間おきに解析を実施しています。上記、更新されていなくても年間を通じて解析していますので、お気軽にお問い合わせください。

その他、MiSeqシーケンス、メタ16S解析、ショットガンメタゲノム解析、ご相談下さい。

ナノポアシーケンサーによるメタ16S全長シーケンスコロニーシーケンスダイレクトも開始しました!

 

NanoporeシーケンサーGridIONによる解析

Nanopore社のCertificationを取得し、受託解析を開始しました。

ロングリードのナノポアテクノロジーだから可能になった、メタ16S全長シーケンス、真菌叢解析、微生物全ゲノム解析等を実施します。

主な業務内容

口腔常在微生物叢解析センター外観・唾液、プラークなど口腔サンプルのメタゲノム解析、受託
・その他、糞便等の臨床サンプル、土壌、河川水等のメタゲノム解析、受託・共同研究
・次世代シークエンス解析の受託・共同研究
・デジタルPCR/リアルタイムPCRを用いた微生物DNA検出 (口腔微生物DNA解析の受託)
・培養による微生物検出(細菌・真菌)、薬剤感受性試験等

 

お知らせ

(2018.10.10) ナノポアシーケンサーによるコロニーシーケンスダイレクトを開始しました。
(2018.08.25) ナノポアシーケンサーによるメタ16S全長シーケンスを開始しました。
(2018.08.4) 糞便や唾液等からのDNA抽出サービスを開始しました。
(2018.06.4) Nanoporeの認証を取得。GridIONを用いた受託解析サービスを開始しました。
(2018.01.18) 第3世代シーケンサー GridION(Nanopore社)を導入しました。

(2017.10.27) 山田養蜂場 みつばち研究基金 研究助成に採択されました。
(2017.8.4)  イルミナウェビナーで講師を務めました。
(2017.7.13) 「松本歯科大学大学院セミナー」 で講師を務めました。
(2017.2.2) 「岡山大学大学院セミナー」 で講師を務めました。

(2016.12.11) 「口腔感染症フォーラム2016」にて講演しました。
(2016.10.09) 口腔検査学会にてポスター発表してきました。
(2016.05.09) NHKの情報番組「あさイチ」にて、メタゲノム解析・撮影に協力いたしました。
(2016.05.01)「歯界展望」で「連載 口腔細菌叢のメタゲノム解析」が始まりました。
(2016.03.04) ゲノム微生物学会にてポスター発表しました。

(2015.10.28)「歯界展望」に「特集 口腔細菌叢のメタゲノム解析~臨床応用と可能性」を寄稿しました。(2015.10.04) 日本口腔検査学会(横須賀)で発表した演題が優秀発表賞に選出されました。
(2015.8.26) イルミナ西日本ユーザーミーティング(京都)にて発表しました。
(2015.7.11) 歯内療法学会(横浜鶴見)でポスター発表しました。
(2015.7.03) NGS現場の会(つくば)でポスター発表しました。たくさんの「いいね!」を頂きました。

(2014.12.16) 日本歯科新聞で当センターの取り組みが紹介されました。
(2014.07.04) 当施設で初めてメタゲノム解析を行いました。
(2014.06.04) 次世代シークエンサーMiSeqが納入されました。
(2014.04.02) 解析センターを開設しました。

(C)谷口歯科医院・口腔常在微生物叢解析センター・クリニカルメタゲノミクスセンター,2014. 香川県高松市常磐町1-9-14 2-3-35 アシクロビル1・2階  無断転載禁止