口腔常在微生物叢解析センター マイクロバイオーム細菌叢解析

 

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次世代シークエンサーMiSeq

 次世代シークエンサー(NGS)とは

 遺伝情報(DNAを構成するヌクレオチドの塩基配列)を解読することをシークエンシングといい、それに用いる装置をDNAシークエンサーといいます。従来型のDNAシークエンサーは、少ない配列を正確に読むのに長けていましたが、ヒトゲノムの解析のように大量の塩基配列を解読するためには多大な労力とコストが必要とされていました。

それに対して、近年まったく新しい原理で大量の塩基配列を解読する装置が開発されました。それが次世代シークエンサーです。現在、数社からいくつかの次世代シークエンサーが開発・発売され、国内・海外の主要な研究機関で使用されています。

 

 

MiSeq

 イルミナ社が開発した次世代シークエンサーの一つです。卓上型のNGSですが、いくつか出ている次世代シークエンサーの中でも、比較的長い配列を精度良く読めるのが特徴です。ヒトの全ゲノム配列の解読には向いていませんが、部分的な配列の解読や微生物のゲノム配列の解読には大きな力を発揮します。

NGS_miseq

日本の一般の医療機関で初めて導入

当センターはこの最新の解析装置を国内の一般の医療機関で初めて導入しました(イルミナ社談)。また世界的にも研究機関以外の施設で導入されることは珍しく、少なくとも世界の歯科医院では初めてだと思われます。

導入コスト、年間維持コスト、そしてRunningコスト、全てにおいて大きな負担を強いられる装置で不安もありますが、これからは口腔の微生物遺伝子をターゲットに治療や予防を考えていく時代になるのではないでしょうか。

MiSeqの受託解析

MiSeqを使用する次世代シークエンスの受託解析も行っています。試薬カートリッジ代+αの費用で、サンプル調整済みのサンプルのシークエンス、あるいは直接持参してRunして頂けるように考えています。

遺伝性疾患、癌や自閉症関連遺伝子の解析など各種遺伝子変異解析に使用できます。詳しくはイルミナ社ホームページをご覧下さい。

着床前遺伝子スクリーニング や HLAタイピング の解析キットが近々販売される予定で、次世代シークエンサーが世界をどう変えていくのか、ワクワクしてなりません。

ヒト白血球抗原(HLA)タイピング製品 (TruSight HLA シーケンスパネル)の動画

MiSeq®科学捜査ゲノム解析システム (品名:MiSeq FGx)の動画

映画のような世界ですが、まさにそれが次世代シークエンサーによって実現されようとしています。
その現場に立ち会えることに心が躍ります。

参考文献

イルミナ社Miseq
NGS現場の会

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