口腔常在微生物叢解析センター マイクロバイオーム細菌叢解析

 

一般の方からのサンプル受付
MetaDentProject

谷口歯科医院

 

 

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香川県高松市常磐町2-3-35 087-831-8020 

解析機器・設備

当センターの機器等をご紹介します。
大学の研究室にも引けをとらない充実の研究設備です。

 

 

 

 

主な解析機器・微生物検査機器

次世代シークエンサー MiSeq

NGS_miseq シークエンサーとは遺伝情報(DNAの塩基配列)を解読する機械で、メタゲノム解析を行うのにはなくてはならない機器です。メタゲノム解析だけでなく、遺伝疾患、癌や自閉症などの遺伝子変異の解析など、様々な遺伝子の研究に使用できます。大学等の研究機関をのぞいて、一般の医療機関で初めて導入しました(イルミナ社談)。どこに行っても驚かれます。→次世代シークエンサーMiSeqについて

 

リアルタイムPCR機

 遺伝子の量を正確に測定する器械です。次世代シーケンス前のサンプル確認や結果の検証するために使用します。また口腔内の虫歯菌、歯周ポケット内の歯周病細菌の遺伝子を正確に測定することで、菌の数を推定することにも使用します。→リアルタイムPCRによる細菌の検出

 

サーマルサイクラー(PCR機)+電気泳動装置

 遺伝子の増幅に使用する装置で、基礎研究ではごく普通に使用されています。当センターでは、簡単な遺伝子のチェックや増幅だけでなく、次世代シークエンサーにかけるサンプルの前処理に使用します。PCRで増幅を終えたサンプルは、電気泳動を行い染色して増幅、サイズを確認します。

 

顕微鏡

顕微鏡 微生物の観察に使用するカールツアイス社製の顕微鏡です。
 グラム染色等の様々な染色をして微生物の観察ができます。
 また、染色せず生きたまま観察できるよう位相差顕微鏡も兼ねています。
(将来的に蛍光顕微鏡にしたいので、対応した鏡基にしています)

 

 

 

 

微生物を安全に取り扱うために必要な装置

 ハザードキャビネット

安全キャビネットハザードキャビネット(旧・安全キャビネット)は、外の空気が中に入らず、中の空気が外に出ないように作られた専用の作業台です。非常にクリーンな環境で、実験が行えます。また微生物が外に漏れないよう設計されているため、内部で安全に微生物を取り扱うことが可能です。

 

 


 

 オートクレーブ (高圧蒸気滅菌器)と乾熱滅菌器

培地類の滅菌、解析の終えたサンプルや使用した器具を高圧蒸気滅菌する装置です。

※解析センター専用のオートクレーブを2台使用し、院内の器具の滅菌には使用していません。

 

 乾熱滅菌器

湿気に弱い器具類を180℃の高温で滅菌処理する装置です。水洗した器具の乾燥にも使用できます。

 

その他汎用機器

 Qubit2.0

DNA、RNA、タンパク質の濃度を測定する装置です。蛍光を利用するため微量な濃度のサンプルでも正確な値を測定できます。

 

 超純水精製機

水がないと実験室は始められません。
分子生物学グレードの超純水を生成するための装置です。

 

 

 

 

 

 

 冷却遠心機

最高で1万5千回転/分で回転します。菌の遠心分離、DNAの抽出、精製等に使用します。

 

 冷凍庫(-30℃) 超低温冷凍庫(-80℃)

-30℃、-80℃でサンプルや試薬を冷凍保存します。

 

 ヒートブロック

サンプルのインキュベート(熱処理)に使用します。

 

 インキュベータ(孵卵器)

細菌の培養に使用します。細菌が発育するのに適した温度に設定されています。

 

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